Blog single photo

Spillere nøyaktig designer brettede proteiner så realistiske som de som er laget av eksperter - SciTechDaily

Sammenligning av høyresolutt røntgenkrystallografiresultater (grå) med Foldit-spillerdesignede proteinmodeller (regnbue). Tverrsnitt viser detaljerte sammenligninger av kjernen sidekjeder. Kreditt: Foldit, avansert lyskilde De unike måtene proteiner bretter sammen dikterer deres samspill med sykdommer og medisiner, så det å forstå deres vendinger er nøkkelen til å utforme effektive medisiner. Mens nytt legemiddeldesign er seriøst arbeid, kan du oppdage hvordan proteiner brettes kan være morsomt: Et crowddsourcing-spill kalt Foldit lar spillerne prøve forskjellige brettkonfigurasjoner for poeng og rangering. I en nylig utfordring kom Foldit-spillerne opp med 56 design som ble gjengitt som stabile strukturer i et laboratorium. Og røntgenundersøkelser ved Berkeley Labs avanserte lyskilde bekreftet at tre av disse proteinene virkelige strukturer samsvarer med spillergenererte modeller. Et fjerde proteinutforming ble verifisert ved bruk av en teknikk kjent som kjernemagnetisk resonansspektroskopi. Disse spillerne hadde liten eller ingen trening på dette feltet, selv om modellene deres viste seg å være like realistiske som de som ble laget av eksperter og sofistikerte dataprogrammer. Suksessene deres ble fremhevet i et vitenskapelig brev publisert i tidsskriftet Nature. Nå håper University of Washington-forskere bak Foldit å introdusere nye utfordringer som kan føre til at spillere utformer faktiske medisiner som fungerer bedre enn de som nå er tilgjengelige. Denne innsatsen kan være til fordel for det voksende biofarmasøytiske feltet hvor kopier av eksisterende proteiner og modifiserte versjoner av dem brukes til å bekjempe kreft og andre sykdommer. �Nå at vi har sett spillere nøyaktig kan designe brettede proteiner, vil vi gjerne utfordre spillerne med vanskeligere designproblemer, � sa Brian Koepnick, forskningsforsker ved University of Washington og Foldit-utvikleren. Henvisning: �De novo protein design av innbyggerforskere� av Brian Koepnick, Jeff Flatten, Tamir Husain, Alex Ford, Daniel-Adriano Silva, Matthew J. Bick, Aaron Bauer, Gaohua Liu, Yojiro Ishida, Alexander Boykov, Roger D. Estep , Susan Kleinfelter, Toke N�rg�rd-Solano, Linda Wei, Foldit Players, Gaetano T. Montelione, Frank DiMaio, Zoran Popovi ?, Firas Khatib, Seth Cooper og David Baker, 5. juni 2019, Nature. DOI: 10.1038 / s41586-019-1274-4 Les mer



footer
Top